Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞癌的生存率生物标志物

2021-11-29 09:20:00 来源:
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这项科学研究旨在确定一种可以预测输尿管鳞状细胞癌(ESCC)症状总体成功率(OS)的miRNAs附加。

从NCBI GEO获得119名ESCC症状的miRNA表达谱及其相应的临床的资讯,并将其作为训练集。在早期和晚期采样间筛选差异普遍性表达的miRNAs(DEmiRNAs)。用于Cox紧接著系统性、递归特征消除(RFE)-拥护向量机(SVM)算法和LASSO Cox紧接著假设来识别病因普遍性miRNAs,从而设立病因打分假设。此外,预测了这些病因普遍性miRNAs的有前途靶等位基因,然后框架了miRNA靶等位基因在线。通过功能钼系统性,系统性了ESCC中这些病因普遍性miRNAs预测靶等位基因的功能相关普遍性。

在训练高度集中,早期与晚期采样有46个DEmiRNAs。设立了基于5个miRNAs的风险打分假设。该5-miRNA风险打分可以将训练集分为OS时长明显不同的高危组和低危组。在一个来自癌症等位基因组记事(TCGA)的单独数据高度集中,取得成功有效普遍性了5-miRNA风险打分的风险各别灵活普遍性。已确定了与这些miRNAs相关的各种生物学过程和路中,例如Wnt信号路中、TRP通道的炎症电磁场抑制路中和睾酮信号路中。

这项科学研究若有,与解剖分期相关的5-miRNA附加对预测ESCC症状的病因带有临床意义。

原始出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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